Gut microbiota modulation for enhanced efficacy and reduced toxicity of chemotherapy in pediatric acute leukemias: a review
- Authors: Murtazin A.A.1, Islamgulov A.K.1, Malievsky V.A.1
-
Affiliations:
- Bashkir State Medical University
- Issue: Vol 28, No 5 (2026): Gastroenterology
- Pages: 366-373
- Section: Articles
- Published: 09.06.2026
- URL: https://consilium.orscience.ru/2075-1753/article/view/692796
- DOI: https://doi.org/10.26442/20751753.2026.5.203517
- ID: 692796
Cite item
Full Text
Abstract
Background. Acute leukemias (AL) represent the most prevalent oncological pathology in the pediatric population. Despite the progress achieved in treatment, primarily through chemotherapy (CT) and hematopoietic stem cell transplantation, the management of this disease is associated with various complications, such as mucositis, febrile neutropenia, systemic infections, and graft-versus-host disease (GVHD). The gut microbiota (GM) plays a crucial role in modulating both the efficacy of CT and the development of its toxicity. CT-induced dysbiosis is associated with worsened treatment outcomes, underscoring the relevance of exploring strategies for its correction.
Aim. To systematize current data on the role of GM in the pathogenesis of complications and the efficacy of AL therapy in children, and to analyze promising strategies for its targeted modulation aimed at improving treatment outcomes.
Materials and methods. A systematic literature review was conducted in accordance with the PRISMA guidelines. The search for publications was performed in the PubMed/MEDLINE, Google Scholar, and eLIBRARY databases for the period from 2014 to 2025. Out of 5628 identified publications, after excluding duplicates and applying inclusion/exclusion criteria, 63 relevant sources were included in the analysis.
Results. It was demonstrated that CT-induced dysbiosis leads to reduced alpha-diversity, characterized by a decreased abundance of commensal genera (e.g., Faecalibacterium, Lachnospiraceae) and dominance of opportunistic pathogens (e.g., Enterobacteriaceae). These alterations contribute to the development of severe mucositis, febrile neutropenia, systemic infections, and GVHD. The GM also influences the metabolism of cytostatic drugs (e.g., gemcitabine inactivation), intestinal barrier integrity (via the production of short-chain fatty acids), and the systemic immune response. Promising methods for dysbiosis correction include fecal microbiota transplantation, which has shown efficacy in steroid-refractory acute GVHD, as well as the use of probiotics, prebiotics, personalized high-fiber diets, synthetic microbial consortia, and live biotherapeutic products.
Conclusion. The integration of GM modulation strategies into standard AL treatment protocols for children represents a promising approach to enhance the efficacy of CT. However, further randomized controlled trials are required to validate and standardize these strategies, focusing on the assessment of their long-term safety and efficacy.
Full Text
Введение
Острые лейкозы (ОЛ) – наиболее распространенная онкологическая патология в детской популяции, демонстрирующая растущую динамику. В некоторых регионах России отмечается рост смертности от злокачественных новообразований лимфатической и кроветворной ткани на 16% за 2012–2020 гг., что говорит о сохраняющихся проблемах организации оказания помощи детям с таким заболеванием [1].
Достижения в химиотерапии (ХТ) и трансплантологии, включающие трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) как один из основных методов лечения ОЛ, повышают долгосрочную выживаемость пациентов до 90% [2, 3]. Однако такое агрессивное лечение сопряжено с тяжелыми побочными эффектами, наиболее часто из них встречаются мукозиты, нутритивная недостаточность и системные инфекции, которые снижают качество жизни пациентов и остаются причинами существующего процента летальных исходов [2–4]. В этом контексте приобретает актуальность концепция голобионта, рассматривающая макроорганизм и его кишечную микробиоту (КМ) как единую экологическую систему, нарушение которой лежит в основе многих патологических процессов [4]. Современные исследования с использованием технологии секвенирования следующего поколения позволили выявить, что КМ функционирует как эндокринный орган и активно влияет на системные воспалительные процессы, иммунный ответ и даже на метаболизм цитостатиков [2, 3]. Эти данные указывают на то, что дисбиоз может быть не только следствием, но и предвестником или даже фактором риска развития ОЛ.
В исследованиях M. Oldenburg и соавт. и I. Peppas и соавт. продемонстрировано, что у детей на момент диагностики острого лимфобластного лейкоза уже наблюдалось значительное снижение разнообразия микробиома, а также замедление его созревания, ассоциированное с известными эпидемиологическими факторами (кесаревым сечением и недостаточной продолжительностью грудного вскармливания), характеризующееся дефицитом бактерий, продуцирующих короткоцепочечные жирные кислоты (КЦЖК), что, в свою очередь, снижает иммунный ответ и способствует лейкогенезу [4, 5]. В ходе лечения острого лимфобластного лейкоза усугубляющийся дисбиоз, проявляющийся началом преобладания представителей семейства Enterococcaceae, становится предиктором инфекционных осложнений, в частности сепсиса, что подтверждается данными клинических исследований: различия в составе микробиома достоверно связаны с последующим развитием сепсиса (p< 0,0001) [4, 6]. Нарушения состава микробиома могут персистировать долгие годы после завершения ХТ, проявляясь, например, истощением количества бактерий рода Faecalibacterium и способствуя отдаленным неблагоприятным последствиям пациентов [2, 4].
Таким образом, стратегии целенаправленной модуляции микробиома, наиболее перспективные из которых – трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ), пробиотики и пребиотики, рассматриваются как инструмент для повышения эффективности и снижения токсичности ХТ. Опыт применения ТФМ у иммунокомпрометированных пациентов после алло-ТГСК в исследовании О.В. Голощапова и соавт. демонстрирует обнадеживающие результаты в виде полного регресса реакции «трансплантат против хозяина» (РТПХ) и элиминации мультирезистентных патогенов, что говорит об эффективности терапевтического потенциала метода [7].
Цель исследования – систематизация современных данных о роли КМ в патогенезе осложнений и эффективности терапии ОЛ у детей и анализ перспективных стратегий ее целевой коррекции для улучшения исходов лечения.
Материалы и методы
Отбор научных публикаций для данного обзора проводился в соответствии с рекомендациями PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses – Предпочтительные элементы отчетности для систематических обзоров и метаанализов). Алгоритм отбора исследований представлен на рис. 1. В результате поиска извлечено 2387 публикаций из базы данных PubMed/MEDLINE, 1240 публикаций найдено в Google Scholar и 2001 в eLIBRARY. Поисковые запросы включали следующие ключевые слова и их сочетания на русском и английском языках: онкология/oncology, лейкозы/leukemias, химиотерапия у детей / pediatric chemotherapy, токсичность химиотерапии / chemotherapy toxicity, микробиота кишечника / gut microbiota, дисбиоз/dysbiosis, короткоцепочечные жирные кислоты / short-chain fatty acids, пробиотики/probiotics, трансплантация фекальной микробиоты / fecal microbiota transplantation, персонализированная медицина / personalized medicine. Комбинированный поиск включал булевые операторы (AND, OR) для определения релевантности найденных источников. Поиск литературы проводился в течение 4 мес – с мая по август 2025 г., и охватывал публикации за последние 10 лет (2014–2025 гг.), чтобы отразить развитие этой научной области. Все авторы независимо друг от друга провели анализ названий и аннотаций извлеченных статей. При соответствии исследований критериям включения извлекался полный текст соответствующей публикации для детальной оценки. После многоэтапной процедуры отбора в окончательный анализ включено 63 источника.
Рис. 1. Алгоритм поиска исследований.
Fig. 1. Study search algorithm.
Критерии включения:
- публикации, содержащие данные о роли КМ в развитии осложнений ХТ (мукозита, инфекций, нутритивной недостаточности) у детей с ОЛ;
- публикации, исследующие влияние модуляции КМ (пробиотиков, пребиотиков, ТФМ, диеты) на эффективность и переносимость лечения;
- рандомизированные контролируемые исследования (РКИ), проспективные и ретроспективные когортные исследования, метаанализы и систематические обзоры;
- исследования, имеющие в открытом доступе полные тексты на английском и/или русском языках;
- работы, опубликованные в рецензируемых научных журналах.
Критерии исключения:
- дубликаты публикаций;
- исследования, посвященные другим онкологическим заболеваниям (солидным опухолям) или взрослой популяции пациентов без выделения данных по детям;
- работы, не имеющие доступа к полному тексту;
- описания клинических случаев, обзоры литературы без систематической методологии, редакционные статьи и мнения экспертов, не содержащие оригинальных данных;
- исследования на моделях животных без последующего клинического подтверждения на людях.
Современные представления о КМ и ее роли в патогенезе онкогематологических заболеваний
1. Основные понятия
Современные представления о КМ развиваются в направлении от оценки качественного состава к анализу ее функций, а также метагенома (табл. 1). Ключевое значение для современных исследований имеет состояние эубиоза, характеризующееся стабильным разнообразием микрофлоры и ее метаболической активностью, а также дисбиоза, ассоциирующегося с развитием различных патологических состояний [8]. Исследования метагенома демонстрируют, что ХТ индуцирует нарушения, ведущие за собой снижение α-разнообразия микрофлоры, что создает основу для развития различных осложнений [9].
Таблица 1. Основные функции КМ в контексте онкогематологии Table 1. Major functions of intestinal microbiota (IM) in the context of haemato-oncology | |||
Функция | Механизм | Клиническое значение | Источники |
Иммуномодуляция | Влияние на дифференцировку Th17, миграция из кишечника | Патогенез иммуноопосредованных заболеваний и лейкозов | M. Bellone и соавт. [10] |
Метаболизм ХП | Прямая инактивация гемцитабина, влияние на ферменты печени | Повышение эффективности и снижение токсичности ХТ | D. Chrysostomou и соавт. [8] |
Поддержание барьерной функции | Продукция КЦЖК (бутирата), целостность эпителия | Профилактика мукозита, транслокации бактерий | C. Giromini и соавт. [15] |
Колонизационная резистентность | Конкуренция с патогенами | Снижение риска инфекций, нейтропении | Y. Luo и соавт. [9] |
2. Функции КМ в контексте онкогематологии
В контексте онкогематологии наиболее важная функция КМ – иммуномодуляция. Данные исследования M. Bellone и соавт. свидетельствуют о том, что КМ влияет на дифференцировку T-хелперов 17 (Th17), которые, мигрируя из кишечника, играют роль в патогенезе иммуноопосредованных заболеваний и некоторых злокачественных опухолей, в том числе лейкозов, что указывает на общие патогенетические механизмы [10]. Кроме того, КМ непосредственно участвует в метаболизме химиопрепаратов (ХП), что подтверждается данными исследования D. Chrysostomou и соавт. о прямой инактивации гемцитабина и опосредованном влиянии на ферменты печени [8]. Ярким примером служит иринотекан, конверсия которого в токсичный метаболит SN-38, который отвечает за противоопухолевую активность, зависит от бактериального фермента β-глюкуронидазы, а индуцированный им дисбиоз с увеличением численности таких видов, как Veillonella и Clostridium, коррелирует с тяжестью течения диспептических явлений [11].
Не менее важна роль КМ в поддержании целостности кишечного барьера, прежде всего за счет продукции КЦЖК, в особенности бутирата. Проспективное когортное исследование Y. Zeng и соавт. демонстрирует, что изменения в популяции бактерий, продуцирующих бутират, ассоциированы с развитием вторичной резистентности к ХТ, а тенденция к их снижению наблюдается при осложнениях [12]. Эта же функция тесно связана с противовоспалительным потенциалом микробиома и ее способностью обеспечивать колонизационную резистентность, нарушение которой, например, под действием антибиотиков широкого спектра ведет к колонизации кишечника мультирезистентными штаммами Klebsiella и Escherichia coli, которые повышают риск нейтропении [9]. Анализ базы данных KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes – Киотская энциклопедия генов и геномов) подтверждает, что ХТ приводит к нарушению метаболических путей, что отражается на системном уровне в виде кахексии, истощения путей биосинтеза аминокислот с разветвленной цепью и витаминов на фоне увеличения потенциала к биосинтезу липополисахаридов [13].
3. Клиническое значение состояния КМ в контексте исходов лечения
Интеграция полученных данных модуляции КМ в клиническую практику демонстрирует измеримо высокий терапевтический потенциал. По данным проспективного когортного исследования S. Nguyen и соавт. с участием 301 пациента выявлено, что высокое α-разнообразие КМ до начала ХТ считается предиктором снижения риска тяжелой гематологической токсичности [отношение шансов (ОШ) 0,94; p=0,048] и нейтропении (ОШ 0,94; p=0,016), при этом таксоны типа Synergistota оказывали протективный эффект, а отдельные представители рода Firmicutes ассоциировались с более высоким риском [14]. Эти результаты напрямую связывают исходное состояние микробного сообщества с переносимостью лечения пациентами, что подтверждает гипотезу о целесообразности первостепенной роли коррекции дисбиоза.
4. Механизмы защиты от побочных эффектов ХТ и методы коррекции микробиома
Наиболее важный механизм, опосредующий защиту от токсичности ХТ, – поддержание барьерной функции кишечника, где центральная роль отводится КЦЖК, в частности бутирату. Данные исследования C. Giromini и соавт. подтверждают, что бутират не только обеспечивает барьерную функцию in vitro, повышая экспрессию белков плотных контактов (ZO-1, клаудин-1) и муцинов (MUC2, MUC5AC) на модели клеток HT29-MTX-E12, но и оказывает выраженный терапевтический эффект при мукозитах [15]. Учитывая, что дефицит бутирата и бактерий-продуцентов тесно связан с развитием мукозита [16], перспективна таргетная модуляция микробиома с применением специфических штаммов, таких как Clostridium butyricum (CBM588).
Помимо описанных функций микробиома ярко иллюстрируется способность формирования резистентности к ХП на примере гемцитабина [17]. При этом прямая связь с лейкозами требует дальнейшего изучения, сам факт модуляции микробиотой эффективности цитостатиков подчеркивает универсальность описанных механизмов. Конвергенция данных из фундаментальных и клинических исследований формирует обоснование для внедрения мультимодальной модели онкомикробиома [8, 18], в которой оценка микробного статуса и последующая адъювантная модуляция микробиома, направленная на поддержание эубиоза и функций КЦЖК, – неотъемлемый компонент ХТ ОЛ у детей, имеющий потенциал к повышению ее эффективности.
Особенности течения дисбиоза кишечника у детей на фоне ХТ при ОЛ
Введение ХТ у детей с ОЛ приводит к серьезным нарушениям в экосистеме кишечного микробиома, которые становятся предиктором развития осложнений настоящего лечения (табл. 2) [19]. Непосредственное цитотоксическое действие ХП на быстро пролиферирующие клетки кишечного эпителия и саму микробиоту в сочетании с массивной антибиотикопрофилактикой становятся инициирующими факторами дисбиоза у детей [19]. Эти изменения приводят к нарушениям нутритивного статуса, ведущего к анорексии и необходимости введения парентерального питания, которое замедляет восстановление состава микрофлоры кишечника и продукцию КЦЖК (рис. 2) [20]. Исследование M. Adel и соавт. демонстрирует, что индукционная ХТ закономерно приводит к снижению α-разнообразия микробиома, которое лишь частично восстанавливается к концу курса лечения [19]. Таксономический профиль претерпевает изменения за счет снижения доли комменсальных родов, таких как Faecalibacterium и семейства Lachnospiraceae, при одновременном обогащении потенциально патогенными таксонами из семейства Enterobacteriaceae [21, 22]. Исходно более высокое α-разнообразие в виде Faecalibacterium, Ruminococcus, Blautia на момент диагностики ассоциируются с более благоприятными исходами ХТ, что указывает на прогностическую ценность параметров КМ до начала терапии [22]. Полученные данные о характере дисбиоза напрямую коррелируют с исходами лечения. Снижение разнообразия комменсальной флоры и доминирование условно-патогенных бактерий тесно связаны с риском развития фебрильной нейтропении и мукозита [19, 23]. Эпидемиологическое исследование M. Guarana и соавт. демонстрирует, что бактериемия, вызванная представителями E. coli, Klebsiella pneumoniae и Enterobacter spp., ассоциирована с повышенным риском развития шока и ранней смертности у пациентов этой группы [24]. В отдаленной перспективе дисбиоз играет роль в развитии осложнений, таких как РТПХ после ТГСК. Наименьшее α-разнообразие наблюдается именно у пациентов с РТПХ, а повышенное содержание таксонов Pasteurellaceae и Enterococcaceae в посттрансплантационном периоде ассоциируется с тяжестью диспептических явлений [25]. Важно отметить, что вызванные ХТ изменения КМ могут иметь стойкий характер, и даже после завершения лечения и достижения ремиссии состав микрофлоры не всегда восстанавливается, сохраняя отличия от здоровых детей, что влияет на качество жизни пациентов [26].
Таблица 2. Характеристика течения дисбиоза при ОЛ у детей Table 2. Dysbiosis characteristics in children with acute leukemia (AL) | |||
Параметр | До начала ХТ | Во время проведения ХТ | После проведения ХТ |
α-разнообразие | Снижено на момент диагностики | Значительно снижено | Частичное восстановление |
Таксономическое разнообразие | ↓Faecalibacterium, ↓Ruminococcus, ↓Blautia | ↓Lachnospiraceae, ↑Enterobacteriaceae | Стойкие отличия от здоровых детей |
Метаболиты | ↓ КЦЖК (бутирата) | Значительное ↓КЦЖК | Медленное восстановление |
Клинические корреляции | Прогноз исходов ХТ | Риск развития мукозита, нейтропении, инфекций | Влияние на качество жизни, риск РТПХ |
Рис. 2. Порочный круг патогенеза ХТ – дисбиоз.
Fig. 2. The vicious circle of “chemotherapy(CT)-dysbiosis” pathogenesis.
Исследование E. Margolis и соавт. доказывает, что у детей, перенесших ТГСК, сигнатуры облигатных и факультативных анаэробов можно считать маркером бактериемии (HR 3.89), а соотношение оральных и кишечных анаэробов при нормальном уровне нейтрофилов характеризовало риск вирусного энтероколита (HR 1.96) [27]. Более того, выявление до ТГСК дисбиоза со сниженным содержанием Blautia и увеличением Fusobacterium позволяет прогнозировать развитие острой РТПХ, что создает основу для превентивной ТФМ у пациентов из группы высокого риска [28]. Накопленные данные формируют научную базу для разработки интервенционных стратегий, направленных на коррекцию микробного дисбаланса с целью улучшения процессов восстановления после ХТ при ОЛ, снижения частоты инфекционных осложнений и тяжести мукозита, а также профилактики РТПХ, что в конечном итоге может существенно повысить выживаемость и качество жизни детей, перенесших ОЛ.
Роль КМ в формировании ответа на ХТ и лекарственной устойчивости
В настоящее время КМ рассматривается как модулятор эффективности ХТ и потенциальный фактор лекарственной устойчивости, что открывает различные перспективы для разработки персонализированных стратегий лечения в онкологии. Данные исследования Е.И. Олехновича и соавт. свидетельствуют о влиянии отдельных бактериальных штаммов и их метаболитов на фармакокинетику и фармакодинамику цитостатиков [9]. Яркий пример – прямой метаболизм ХП микробными ферментами, который может изменять их биодоступность и терапевтическую активность. Так, в исследованиях S. Sayin и соавт. и G. Xu и соавт. продемонстрировано, что бактерии, экспрессирующие цитидиндеаминазу, в частности некоторые штаммы E. coli, а также Aggregatibacter actinomycetemcomitans, способны инактивировать гемцитабин, нуклеозидный аналог, путем его дезаминирования, что приводит к развитию лекарственной резистентности опухолевых клеток [29, 30]. Этот механизм не зависит от длины изоформы цитидиндеаминазы, что наглядно демонстрирует, как дисбиоз, характеризующийся накоплением указанных выше таксонов, может напрямую снижать эффективность лечения. Адаптация бактерий к ХП, например, путем инактивации нуклеозидного переносчика NupC у E. coli, может увеличивать лекарственную нагрузку на соседние раковые клетки, указывая на сложный, динамичный и контекст-зависимый характер бактериально-лекарственных взаимодействий в опухоли [29]. Эти данные указывают на необходимость мониторинга не только генетических маркеров резистентности в опухолевых клетках, но и микробных таксонов, способных к модификации ХТ.
Еще один важнейший механизм влияния КМ в ответ на ХТ – системная модуляция противоопухолевого иммунитета, в котором микробные метаболиты выступают в качестве кофакторов биохимических реакций [9, 31]. Бутират и другие КЦЖК, продуцируемые комменсальными родами, такими как Faecalibacterium и представителями семейства Lachnospiraceae, способны усиливать эффективность оксалиплатина и других цитостатиков за счет активации цитотоксической функции CD8+ Т-лимфоцитов в опухоли путем запуска механизма, зависимого от транскрипционного фактора ID2 и сигнального пути ИЛ-12 [32]. Это подтверждается данными исследования С.И. Павловой, в котором у пациентов, имевших ответ на терапию оксалиплатином, уровень бутирата в сыворотке крови значимо выше, чем у резистентных к терапии пациентов. Таким образом, можно предположить, что обеднение микрофлоры бутират-продуцентами на фоне ХТ – характерный признак дисбиоза, который может ослаблять противоопухолевый иммунитет, повышая тем самым лекарственную резистентность. Помимо метаболических функций КМ участвует в поддержании гомеостаза иммунных клеток, в частности баланса между провоспалительными Th17-лимфоцитами и противовоспалительными Treg-клетками, который важен для адекватного иммунного ответа [33]. Дисбиоз, вызванный лечением, может смещать этот баланс в сторону продукции провоспалительных факторов, что, с одной стороны, потенциально может усиливать противоопухолевую активность, с другой – усугублять иммуноопосредованную токсичность [34]. Это подчеркивает дуализм иммуномодулирующей функции КМ и необходимость поиска методов балансировки состава микрофлоры.
Таким образом, формируется гипотеза о том, что индуцированный ХТ дисбиоз может способствовать развитию вторичной лекарственной устойчивости лейкозных клеток не только через прямую инактивацию препаратов, но и опосредованно, через создание иммуносупрессивной и провоспалительной микросреды, нарушающей эффективный иммунный надзор. В исследовании S. Pötgens и соавт. у пациентов с острым миелоидным лейкозом интенсивная терапия приводила к глубоким и длительным изменениям в составе и метаболической активности КМ, включая снижение синтеза бактериальных аминокислот, что коррелирует с нарушением функции кишечного барьера и метаболическими нарушениями [35]. Можно предположить, что такое устойчивое нарушение микробного сообщества создает условия для хронического системного воспаления и иммунной дисрегуляции, что, в свою очередь, снижает чувствительность лейкозных клеток к последующим курсам терапии и способствует селекции резистентных клонов. В исследовании C. Vicente-Duenas и соавт., проведенном на лабораторных мышах, имевших предрасположенность к лейкозу, показано, что нарушение микробиома, вызванное антибиотиками, привело к индукции лейкозогенеза, что указывает на протективную роль комменсальной КМ в подавлении онкогенеза [36]. Этот защитный эффект утрачивается при дисбиозе, который также может быть индуцирован и при ХТ, что создает условия для прогрессирования заболевания и развития резистентности.
Современные стратегии модуляции КМ у пациентов с ОЛ
Пробиотики и пребиотики, ТФМ
В свете описанных данных о роли дисбиоза кишечника в патогенезе осложнений на фоне ХТ при лечении ОЛ у детей актуален активный поиск стратегий модуляции КМ. Среди современных методов применение пробиотиков и пребиотиков наиболее изучено и доказано, но остаются дискуссионные вопросы в контексте их применения у иммунокомпрометированных пациентов. Метаанализ РКИ, проведенный B. Yang и соавт., продемонстрировал, что использование пероральных пробиотиков статистически значимо снижает риск развития тяжелого мукозита [относительный риск 0,61, 95% доверительный интервал (ДИ) 0,53–0,72] и мукозита средней и легкой степени тяжести (относительный риск 0,90, 95% ДИ 0,82–0,98), причем многоштаммовые препараты показали наибольшую эффективность по сравнению с одноштаммовыми [37]. Однако эти данные получены в гетерогенных популяциях, и их прямая экстраполяция на детей с лейкозами, особенно в фазу глубокой нейтропении, требует осторожности. Барьером для использования этого метода у детей с ОЛ служит потенциальный риск транслокации пробиотических штаммов и развития бактериемии, что в условиях агранулоцитоза может иметь фатальные последствия [38, 39]. Международные клинические рекомендации для пациентов, перенесших ТГСК, не включают применение пробиотиков в рутинную практику для профилактики инфекции Clostridium difficile [40]. В детской онкологии, с учетом описанных данных, акцент смещен в сторону коррекции питания посредством диет, в которых адекватное потребление пищевых волокон демонстрирует позитивное влияние на поддержание микробного гомеостаза. В исследовании S. Zhou и соавт. доказано, что потребление макро- и микронутриентов, включающих углеводы, клетчатку, β-каротин и витамин B6, положительно коррелирует с уровнем α-разнообразия КМ у детей, прошедших ХТ по поводу ОЛ [41]. Данные экспериментальных моделей подтверждают, что диета с высоким содержанием клетчатки способствует увеличению численности продуцентов КЦЖК (Lactobacillus, Bifidobacterium) и снижению патогенных штаммов Enterobacteriaceae, что ассоциируется с улучшением гистопатологических показателей кишечной стенки и снижением кишечной проницаемости при мукозите [42].
Наиболее радикальный и сложный метод модуляции КМ – ТФМ, успешно зарекомендовавшая себя в лечении рецидивирующей инфекции C. difficile [43, 44]. Опыт применения ТФМ в онкогематологии, изначально ограниченный нозологией, постепенно расширяется, что дает возможности лечения таких осложнений, как стероидорезистентная острая РТПХ после аллогенной ТГСК [45, 46]. В проспективном когортном исследовании О.В. Голощапова и соавт. у пациентов после ТГСК с сочетанной инфекцией C. difficile и оРТПХ ТФМ продемонстрировала высокую клиническую эффективность, при этом полный положительный ответ достигнут у 64% пациентов – с низкой частотой диспептических явлений, кишечного кровотечения и абдоминального болевого синдрома, а также нормализацией состава микрофлоры кишечника в виде увеличения общей бактериальной массы, Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., E. coli и ключевого комменсала Faecalibacterium prausnitzii [47]. Аналогичные результаты, показывающие разрешение рефрактерной диареи без серьезных осложнений, связанных с проведением ТФМ, получены и в других исследовательских центрах [48]. Однако в педиатрической практике существуют ограничения для широкого внедрения ТФМ. Помимо очевидных рисков передачи оппортунистических инфекций существует проблема отсутствия стандартизированных протоколов отбора доноров, подготовки трансплантата и определения оптимального времени проведения процедуры у детей с активным ОЛ [40, 49]. Текущие международные клинические рекомендации для детей с онкологическими заболеваниями после ТГСК не имеют четко определенных показаний для применения ТФМ у детей с ОЛ, что подчеркивает необходимость накопления данных в РКИ, специализирующихся на детях с ОЛ [40]. Исходя из этого ТФМ имеет определенные перспективы применения с целью коррекции дисбиоза и профилактики осложнений ХТ, ее внедрение в рутинную педиатрическую практику ограничивается отсутствием доказательной базы безопасности, что требует дополнительных РКИ с целью определения соотношения пользы и рисков.
Диетические программы и перспективные «бактериальные препараты»
С целью оптимизации лечения ОЛ разрабатывают специализированные диеты, учитывающие нутритивный статус, метаболизм и состав КМ пациентов данной группы. Исследование S. Zhou и соавт. демонстрирует, что дети после ХТ потребляют значительно больше макронутриентов и антиоксидантов (витамины Е, С, селен) в сравнении со здоровой группой, причем адекватное потребление витамина B6 и селена положительно коррелирует с показателем α-разнообразия КМ (Chao1 и Pielou's_e) [50]. Результаты указывают на возможность персонализированного контроля нутритивного статуса, направленного на поддержку роста комменсальных таксонов бактерий путем обеспечения их необходимыми субстратами. Интерес представляют специализированные питательные смеси и диеты с высоким содержанием клетчатки, служащие источником энергии для симбионтных бактерий, продуцирующих КЦЖК, в частности бутират, которые играют ключевую роль в поддержании гомеостаза слизистой оболочки кишечника, снижении воспалительных процессов и модуляции иммунного ответа, что важно для профилактики риска мукозита и других осложнений ХТ [51]. Рациональное питание, выходящее за рамки простого обеспечения суточной калорийности, может стать дополнительным инструментом мягкой коррекции дисбиоза. Однако, как подчеркивается в современных обзорах, стандартные диетические рекомендации могут быть неприменимы у пациентов данного профиля, что требует разработки персонализированных схем питания, основанных на глубоком фенотипировании, включая генетические особенности и метаболомный профиль КМ [52–54].
В разработке находятся «бактериальные» препараты, которые могут заменить пробиотики. Эти препараты – синтетические микробные консорциумы и синбиотики, разрабатываемые с учетом конкретных метаболических показателей пациентов с ОЛ [55, 56]. В отличие от моноштаммовых препаратов консорциумы, состоящие из нескольких взаимодействующих видов, способны выполнять сложные функции, включающие заселение кишечника в условиях воспаления, производство специфических метаболитов и вытеснение патобионтов. Яркий пример – препарат GUT-108, представленный в исследовании D. van der Lelie и соавт., – консорциум из 17 штаммов, который в экспериментальных моделях не только предотвращает развитие колита, но и индуцирует регрессию уже существующего воспалительного процесса за счет продукции противовоспалительных метаболитов и увеличения численности резидентных штаммов бактерий [57]. Прогресс в синтетической биологии, включая разработку ортогональных систем межклеточной коммуникации (например, на основе ацил-гомосеринлактонов), позволяет рационально проектировать такие консорциумы с определенными свойствами [58]. Эти продукты, классифицируемые как живые биологические средства (ЖБС), в настоящее время проходят строгую оценку, аналогичную лекарственным препаратам, что гарантирует их безопасность и качество [59, 60]. Одобрение FDA (Food and Drug Administration – Управление по контролю пищевых продуктов и лекарств в США) первых ЖБС, таких как Rebyota и Vowst, знаменует собой важную веху и открывает возможность их применения в лечении детей с онкогематологической патологией [61]. В контексте ОЛ у детей востребовано направление, связанное с созданием консорциумов, способных не только снижать токсичность ХТ, но и модулировать фармакокинетику ХП, например путем ингибирования бактериальных ферментов, инактивирующих цитостатики [62]. Исходя из этого, переход от эмпирических методов к целевой модуляции КМ с помощью бактериальных препаратов – перспективная траектория в повышении эффективности и безопасности ХТ у детей с ОЛ (табл. 3).
Таблица 3. Перспективные направления модуляции микробиома Table 3. Promising directions of microbiome modulation | |||
Направление | Сущность метода | Стадия разработки | Перспективы применения у детей с ОЛ |
Синтетические микробные консорциумы | Рационально спроектированные сообщества штаммов | Экспериментальные модели, первые ЖБС | Высокие – требует целевой коррекции |
Персонализированное питание | Диеты на основе метаболомного профиля | Исследовательские программы | Средние – требует валидации |
Бактериальные препараты | Живые биологические средства (Rebyota, Vowst) | FDA одобрены для других показаний | Средние – требует оценки безопасности |
Микробиомное профилирование | Мониторинг таксонов-мишеней | РКИ, когортные исследования | Высокие – есть возможность интеграции в клинические протоколы |
Заключение
Проведенный анализ литературы демонстрирует важную роль КМ в модуляции эффективности ХТ у детей с ОЛ. Дисбиоз, как один из ключевых побочных эффектов ХТ, характеризуется снижением α-разнообразия и представительства комменсальных родов, таких как Faecalibacterium, Lachnospiraceae, и увеличением числа условно-патогенных таксонов, таких как Enterobacteriaceae, считается значимым фактором развития осложнений, протекающих в виде мукозита, фебрильной нейтропении, сепсиса и РТПХ при проведенном ТГКС. КМ, помимо рассмотренных функций, также влияет на метаболизм цитостатиков, рассмотренный на примере инактивации гемцитабина, и системный противоопухолевый иммунный ответ, модулируя активность ХТ. Наиболеее перспективными стратегиями коррекции дисбиоза оказались ТФМ, доказавшая эффективность при стероидорезистентной острой РТПХ, персонализированные варианты диет, синтетические микробные консорциумы и ЖБС. Интеграция целенаправленной модуляции микробиома в клинические протоколы лечения ОЛ у детей может повысить эффективность терапии, снизить токсичность и улучшить отдаленные исходы лечения, что требует дальнейших РКИ для валидации и стандартизации таких подходов, а также разработки правил оценки и безопасности введения данных средств.
Раскрытие конфликта интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи.
Disclosure of interest. The authors declare that they have no competing interests.
Вклад авторов. Авторы декларируют соответствие своего авторства международным критериям ICMJE. А.А. Муртазин – концептуализация, формальный анализ, написание – первоначальный вариант; А.Х. Исламгулов – формальный анализ, написание – первоначальный вариант; В.А. Малиевский – управление проектом, написание – рецензирование и редактирование.
Authors’ contribution. The authors declare the compliance of their authorship according to the international ICMJE criteria. A.A. Murtazin − conceptualization, formal analysis, writing – original draft; A.Kh. Islamgulov − formal analysis, writing – original draft; V.A. Malievsky − project administration, writing – review & editing.
Источник финансирования. Авторы декларируют отсутствие внешнего финансирования для проведения исследования и публикации статьи.
Funding source. The authors declare that there is no external funding for the exploration and analysis work.
Раскрытие информации об использовании ИИ. При написании статьи ИИ не использовался.
Disclosing the use of AI. No AI was used when writing the article.
About the authors
Azat A. Murtazin
Bashkir State Medical University
Author for correspondence.
Email: beep.boy.official@gmail.com
ORCID iD: 0009-0001-4491-9495
SPIN-code: 2792-6429
Resident
Russian Federation, Ufa
Almaz Kh. Islamgulov
Bashkir State Medical University
Email: beep.boy.official@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-0567-7515
SPIN-code: 8701-3486
Resident
Russian Federation, Ufa
Viktor A. Malievsky
Bashkir State Medical University
Email: beep.boy.official@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-0522-7442
SPIN-code: 4429-2910
D. Sci. (Med.), Prof.
Russian Federation, Ufa
References
- Улумбекова Г.Э., Петрачков И.В. Онкогематологические заболевания в Российской Федерации и в развитых странах: смертность, заболеваемость, ресурсы и организация медицинской помощи с учетом пандемии COVID-19. Оргздрав: новости, мнения, обучения. Вестник ВШОУЗ. 2022;8(2):22-47 [Ulumbekova GE, Petrachkov IV. Oncohematological diseases in the Russian Federation and in developed countries: mortality, morbidity, resources and organization of medical care taking into account the COVID-19 pandemic. ORGZDRAV: News, Opinions, Training. Bulletin of VSHOUZ. 2022;8(2):22-47 (in Russian)]. doi: 10.33029/2411-8621-2022-8-2-22-47
- Masetti R, Muratore E, Leardini D, et al. Gut microbiome in pediatric acute leukemia: from predisposition to cure. Blood Adv. 2021;5(22):4619-29. doi: 10.1182/bloodadvances.2021005129
- Антошин М.М., Румянцев С.А., Бельмер С.В. Кишечная микробиота: общие представления и значение при остром лимфобластном лейкозе у детей (обзор литературы). Трудный пациент. 2018;16(8-):49-53 [Antoshin MM, Rumyantsev SA, Belmer SV. Intestinal microbiota: general concepts and significance in acute lymphoblastic leukemia in children (literature review). Trudnyi Patsient. 2018;16(8-9):49-53]. doi: 10.24411/2074-1995-2018-10009
- Oldenburg M, Rüchel N, Janssen S, et al. The Microbiome in Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia. Cancers (Basel). 2021;13(19):4947. doi: 10.3390/cancers13194947
- Peppas I, Ford AM, Furness CL, Greaves MF. Gut microbiome immaturity and childhood acute lymphoblastic leukaemia. Nat Rev Cancer. 2023;23(8):565-76. doi: 10.1038/s41568-023-00584-4
- Nycz BT, Dominguez SR, Friedman D, et al. Evaluation of bloodstream infections, Clostridium difficile infections, and gut microbiota in pediatric oncology patients. PLoS One. 2018;13(1):e0191232. doi: 10.1371/journal.pone.0191232
- Голощапов О.В., Чуракина Д.В., Кучер М.А., и др. Трансплантация фекальной микробиоты при критическом состоянии пациентов в онкогематологической практике. Вестник анестезиологии и реаниматологии. 2019;16(3):63-73 [Goloshchapov OV, Churakina DV, Kucher MA, et al. Fecal microbiota transplantation in critical condition of patients in oncohematological practice. Bulletin of Anesthesiology and Resuscitation. 2019;16(3):63-73 (in Russian)]. doi: 10.21292/2078-5658-2019-16-3-63-73
- Chrysostomou D, Roberts LA, Marchesi JR, Kinross JM. Gut microbiota modulation of efficacy and toxicity of cancer chemotherapy and immunotherapy. Gastroenterology. 2023;164(2):198-213. doi: 10.1053/j.gastro.2022.10.018
- Олехнович Е.И., Манолов А.И., Павленко А.В., и др. Влияние микробиома кишечника на эффективность противоопухолевой иммунотерапии. Биомедицинская химия. 2020;66(1):54-63 [Olekhnovich EI, Manolov AI, Pavlenko AV, et al. Influence of gut microbiome on the efficacy of antitumor immunotherapy. Biomed Khim. 2020;66(1):54-63 (in Russian)]. doi: 10.18097/PBMC20206601054
- Bellone M, Brevi A, Huber S. Microbiota-propelled T helper 17 cells in inflammatory diseases and cancer. Microbiol Mol Biol Rev. 2020;84(2):e00064-19. doi: 10.1128/mmbr.00064-19
- Mahdy MS, Azmy AF, Dishisha T, et al. Irinotecan-gut microbiota interactions and the capability of probiotics to mitigate Irinotecan-associated toxicity. BMC Microbiol. 2023;23(1):53. doi: 10.1186/s12866-023-02791-3
- Zeng Y, Shi Q, Liu X, et al. Dynamic gut microbiota changes in patients with advanced malignancies experiencing secondary resistance to immune checkpoint inhibitors and immune-related adverse events. Front Oncol. 2023;13:1144534. doi: 10.3389/fonc.2023.1144534
- Ni Y, Lohinai Z, Heshiki Y, et al. Distinct composition and metabolic functions of human gut microbiota are associated with cachexia in lung cancer patients. The ISME Journal. 2021;15(11): 3207-20. doi: 10.1038/s41396-021-00998-8
- Nguyen SM, Tran HT, Long J, et al. Gut microbiome in association with chemotherapy-induced toxicities among patients with breast cancer. Cancer. 2024;130(11):2014-30. doi: 10.1002/cncr.35229
- Giromini C, Baldi A, Rebucci R, et al. Role of Short Chain Fatty Acids to Counteract Inflammatory Stress and Mucus Production in Human Intestinal HT29-MTX-E12 Cells. Foods. 2022;11(13):1983. doi: 10.3390/foods11131983
- Cazzaniga M, Cardinali M, Di Pierro F, et al. The Potential Role of Probiotics, Especially Butyrate Producers, in the Management of Gastrointestinal Mucositis Induced by Oncologic Chemo-Radiotherapy. Int J Mol Sci. 2024;25(4):2306. doi: 10.3390/ijms25042306
- Mendes I, Vale N. Overcoming Microbiome-Acquired Gemcitabine Resistance in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma. Biomedicines. 2024;12(1):227. doi: 10.3390/biomedicines12010227
- Yin B, Wang X, Yuan F, et al. Research progress on the effect of gut and tumor microbiota on antitumor efficacy and adverse effects of chemotherapy drugs. Front Microbiol. 2022;13:899111. doi: 10.3389/fmicb.2022.899111
- Adel M, Khedr RA, Sayed AA, et al. Changes in Gut Microbial Diversity and Correlation with Clinical Outcome in Children with Acute Myeloid Leukemia Receiving Induction Chemotherapy. Children (Basel). 2025;12(9):1176. doi: 10.3390/children12091176
- D’Amico F, Biagi E, Rampelli S, et al. Enteral Nutrition in Pediatric Patients Undergoing Hematopoietic SCT Promotes the Recovery of Gut Microbiome Homeostasis. Nutrients. 2019;11(12):2958. doi: 10.3390/nu11122958
- Vazquez X, Lumbreras-Iglesias P, Rodicio MR, et al. Study of the intestinal microbiota composition and the effect of treatment with intensive chemotherapy in patients recovered from acute leukemia. Sci Rep. 2024;14(1):5585. doi: 10.1038/s41598-024-56054-w
- Salvestrini V, Conti G, D'Amico F, et al. Gut Microbiome as a potential marker of hematologic recovery following induction therapy in acute myeloid leukemia patients. Cancer Med. 2025;14(3):e70501. doi: 10.1002/cam4.70501
- Immonen E, Paulamäki L, Piippo H, et al. Oral microbiome diversity and composition before and after chemotherapy treatment in pediatric oncology patients. BMC Oral Health. 2025;25(1):981. doi: 10.1186/s12903-025-06405-4
- Guarana M, Nucci M, Nouer SA. Shock and early death in hematologic patients with febrile neutropenia. Antimicrob Agents Chemother. 2019;63(11):e01250-19. doi: 10.1128/aac.01250-19
- Song A, Shen N, Gan C, et al. Exploration of the relationship between intestinal flora changes and gut acute graft-versus-host disease after hematopoietic stem cell transplantation. Transl Pediatr. 2021;10(2):283-95. doi: 10.21037/tp-20-208
- Chua LL, Rajasuriar R, Lim YA, et al. Temporal changes in gut microbiota profile in children with acute lymphoblastic leukemia prior to commencement-, during-, and post-cessation of chemotherapy. BMC Cancer. 2020;20(1):151. doi: 10.1186/s12885-020-6654-5
- Margolis EB, Alfaro GM, Sun Y, et al. Microbiota predict infections and acute graft-versus-host disease after pediatric allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. J Infect Dis. 2023;228(5):627-36. doi: 10.1093/infdis/jiad190
- Biagi E, Zama D, Rampelli S, et al. Early gut microbiota signature of aGvHD in children given allogeneic hematopoietic cell transplantation for hematological disorders. BMC Med Genomics. 2019;12(1):49. doi: 10.1186/s12920-019-0494-7
- Sayin S, Rosener B, Li CG, et al. Evolved bacterial resistance to the chemotherapy gemcitabine modulates its efficacy in co-cultured cancer cells. eLife. 2023;12:e83140. doi: 10.7554/eLife.83140
- Xu G, Jiang Y, Sun C, et al. Role of Oral Bacteria in Mediating Gemcitabine Resistance in Pancreatic Cancer. Biomolecules. 2025;15(7):1018. doi: 10.3390/biom15071018
- Meade S, Kiow J, Massaro C, et al. Gut microbiome-associated predictors as biomarkers of response to advanced therapies in inflammatory bowel disease: a systematic review. Gut Microbes. 2023;15(2):2287073. doi: 10.1080/19490976.2023.2287073
- He Y, Fu L, Li Y, et al. Gut microbial metabolites facilitate anticancer therapy efficacy by modulating cytotoxic CD8+ T cell immunity. Cell Metabolism. 2021;33(5):988-1000. doi: 10.1016/j.cmet.2021.03.002
- Павлова С.И. Роль микробиоты и флавоноидов в поддержании баланса хелперных и регуляторных т-лимфоцитов, ассоциированных с иммунным барьером кишечника. Вопросы питания. 2024;93(1):22-32 [Pavlova SI. The role of microbiota and flavonoids in maintaining the balance of helper and regulatory T-lymphocytes associated with the intestinal immune barrier. Voprosy Pitaniia. 2024;93(1):22-32 (in Russian)]. doi: 10.33029/0042-8833-2024-93-1-22-32
- Anderson R, Theron AJ, Rapoport BL. Immunopathogenesis of immune checkpoint inhibitor-related adverse events: roles of the intestinal microbiome and Th17 cells. Front Immunol. 2019;10:2254. doi: 10.3389/fimmu.2019.02254
- Pötgens SA, Lecop S, Havelange V, et al. Gut microbiota alterations induced by intensive chemotherapy in acute myeloid leukaemia patients are associated with gut barrier dysfunction and body weight loss. Clin Nutr. 2023;42(11):2214-28. doi: 10.1016/j.clnu.2023.09.021
- Vicente-Dueñas C, Janssen S, Oldenburg M, et al. An intact gut microbiome protects genetically predisposed mice against leukemia. Blood. 2020;136(18):2003-17. doi: 10.1182/blood.2019004381
- Yang B, Li W, Shi J. Preventive effect of probiotics on oral mucositis induced by anticancer therapy: a systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials. BMC Oral Health. 2024;24(1):1159. doi: 10.1186/s12903-024-04955-7
- Pedretti L, Leardini D, Muratore E, et al. Managing the Risk of Foodborne Infections in Pediatric Patients with Cancer: Is the Neutropenic Diet Still an Option? Nutrients. 2024;16(7):966. doi: 10.3390/nu16070966
- Simiakova M, Bielik V. The pros and cons of probiotic use in pediatric oncology patients following treatment for acute lymphoblastic leukemia. Front Pediatr. 2024;12:1427185. doi: 10.3389/fped.2024.1427185
- Diorio C, Robinson PD, Ammann RA, et al. Guideline for the management of clostridium difficile infection in children and adolescents with cancer and pediatric hematopoietic stem-cell transplantation recipients. J Clin Oncol. 2018;36(31):3162-71. doi: 10.1200/JCO.18.00407
- Zhou S, Martin M, Powell C, et al. How to maintain a healthy gut microbiome in children with cancer? Gut microbiome association with diet in children with solid tumors postchemotherapy. OMICS. 2022;26(4):236-45. doi: 10.1089/omi.2022.0002
- Gallotti B, Galvao I, Leles G, et al. Effects of dietary fibre intake in chemotherapy-induced mucositis in murine model. Br J Nutr. 2021;126(6):853-64. doi: 10.1017/S0007114520004924
- Jamal R, Messaoudene M, de Figuieredo M, Routy B. Future indications and clinical management for fecal microbiota transplantation (FMT) in immuno-oncology. Semin Immunol. 2023;67:101754. doi: 10.1016/j.smim.2023.101754
- Chen D, Wu J, Jin D, et al. Fecal microbiota transplantation in cancer management: Current status and perspectives. Int J Cancer. 2019;145(8):2021-31. doi: 10.1002/ijc.32003
- Guo Z, He M, Shao L, et al. The role of fecal microbiota transplantation in the treatment of acute graft-versus-host disease. J Cancer Res Ther. 2024;20(7):1964-73. doi: 10.4103/jcrt.jcrt_33_24
- Henig I, Yehudai-Ofir D, Zuckerman T. The clinical role of the gut microbiome and fecal microbiota transplantation in allogeneic stem cell transplantation. Haematologica. 2021;106(4):933-46. doi: 10.3324/haematol.2020.247395
- Голощапов О.В., Кучер М.А., Моисеев И.С., и др. Трансплантация фекальной микробиоты у пациентов после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Клеточная терапия и трансплантация. 2018;7(3):56-7 [Goloshchapov OV, Kucher MA, Moiseev IS, et al. Fecal microbiota transplantation in patients after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Cell Therapy and Transplantation. 2018;7(3):56-7 (in Russian)]. doi: 10.21292/2078-5658-2019-16-3-63-73
- Prayag PS. Patwardhan SA, Ajapuje PS, et al. Fecal Microbiota Transplantation for Clostridium difficile-associated Diarrhea in Hematopoietic Stem Cell Transplant Recipients: A Single-center Experience from a Tertiary Center in India. Indian J Crit Care Med. 2024;28(2):106-10. doi: 10.5005/jp-journals-10071-24607
- Bou Zerdan M, Niforatos S, Nasr S, et al. Fecal Microbiota Transplant for Hematologic and Oncologic Diseases: Principle and Practice. Cancers (Basel). 2022;14(3):691. doi: 10.3390/cancers14030691
- Zhou S, Martin M, Powell C, et al. Associations between Dietary Intakes and the Gut Microbiome in Children with Solid Tumors after Chemotherapy and Healthy Controls. Authorea Preprints. 2021;(2). doi: 10.22541/au.162526069.90949263/v1
- Munteanu C, Schwartz B. Interactions between Dietary Antioxidants, Dietary Fiber and the Gut Microbiome: Their Putative Role in Inflammation and Cancer. Int J Mol Sci. 2024;25(15):8250. doi: 10.3390/ijms25158250
- Wallace TC, Bultman S, D’Adamo C, et al. Personalized nutrition in disrupting cancer – Proceedings from the 2017 American College of Nutrition Annual Meeting. J Am Coll Nutr. 2019;38(1):1-14. doi: 10.1080/07315724.2018.1500499
- Greathouse KL, Wyatt M, Johnson AJ, et al. Diet-microbiome interactions in cancer treatment: Opportunities and challenges for precision nutrition in cancer. Neoplasia. 2022;29:100800. doi: 10.1016/j.neo.2022.100800
- Lagoumintzis G, Patrinos GP. Triangulating nutrigenomics, metabolomics and microbiomics toward personalized nutrition and healthy living. Human Genomics. 2023;17(1):109. doi: 10.1186/s40246-023-00561-w
- Schemczssen-Graeff Z, Pileggi M. Probiotics and live biotherapeutic products aiming at cancer mitigation and patient recover. Front Genet. 2022;13:921972. doi: 10.3389/fgene.2022.921972
- Che S, Men Y. Synthetic microbial consortia for biosynthesis and biodegradation: promises and challenges. J Ind Microbiol Biotechnol. 2019;46(9-10):1343-58. doi: 10.1007/s10295-019-02211-4
- Van der Lelie D, Oka A, Taghavi S, et al. Rationally designed bacterial consortia to treat chronic immune-mediated colitis and restore intestinal homeostasis. Nat Commun. 2021;12(1):3105. doi: 10.1038/s41467-021-23460-x
- Kylilis N, Tuza ZA, Stan GB, Polizzi KM. Tools for engineering coordinated system behaviour in synthetic microbial consortia. Nat Commun. 2018;9(1):2677. doi: 10.1038/s41467-018-05046-2
- Cordaillat-Simmons M, Rouanet A, Pot B. Live biotherapeutic products: the importance of a defined regulatory framework. Exp Mol Med. 2020;52(9):1397-406. doi: 10.1038/s12276-020-0437-6
- Rouanet A, Bolca S, Bru A, et al. Live biotherapeutic products, a road map for safety assessment. Front Med (Lausanne). 2020;7:237. doi: 10.3389/fmed.2020.00237
- Lim ECN, Lim CED. Microbiome-Targeted Therapies in Gastrointestinal Diseases: Clinical Evidence and Emerging Innovations. Acta Microbiologica Hellenica. 2025;70(3):36. doi: 10.3390/amh70030036
- Nowicka A, Tomczak H, Szałek E, et al. Microbial Crosstalk with Therapy: Pharmacomicrobiomics in AML-One Step Closer to Personalized Medicine. Biomedicines. 2025;13(7):1761. doi: 10.3390/biomedicines13071761




