Consilium MedicumConsilium MedicumConsilium MedicumConsilium Medicum2075-17532542-2170Consilium Medicum68971310.26442/20751753.2026.5.203441ArticlesСтатьиReview ArticleA modern perspective on the regulatory role of non-coding RNAs and exosomes in inflammatory bowel disease development: a literature reviewСовременный взгляд на регуляторную роль некодирующих РНК и экзосом в развитии воспалительных заболеваний кишечника: обзор литературыhttps://orcid.org/0009-0006-6548-3033StrelnikovaElizaveta A.СтрельниковаЕлизавета Андреевна
Russian Federation

Teaching Assist.

ассистент каф. госпитальной педиатрии

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0006-7799-9096MardamshinaGuzel R.МардамшинаГузель Рамилевна
Russian Federation

Teaching Assist.

ассистент каф. госпитальной педиатрии

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0009-6906-6343TikhonovaAdelina V.ТихоноваАделина Вадимовна
Russian Federation

Teaching Assist.

ассистент каф. госпитальной педиатрии

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0003-6219-4402ShokurovaEkaterina P.ШокуроваЕкатерина Павловна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0002-7280-457XMerzakhmedovaKamila Kh.МерзахмедоваКамила Хусейновна
Russian Federation

Student

студентка

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0000-5844-1923KamalovaRegina F.КамаловаРегина Фаридовна
Russian Federation

Student

студентка

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0006-4924-3283MingazovDaniil R.МингазовДаниил Ренатович
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0007-8447-5650KhabibullinaSafiya R.ХабибуллинаСафия Рустемовна
Russian Federation

Student

студентка

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0005-8782-2772MagomedovMagomedsaid A.МагомедовМагомедсаид Абдуллаевич
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0006-1491-0402MagomedovaAnisat O.МагомедоваАнисат Омаровна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0003-3863-6821MurtuzovaZhavgarat M.МуртузоваЖавгарат Мурадовна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0000-4053-7556KarabekovaMalena B.КарабековаМалена Балабеговна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0000-1253-4817AmirkhanovaRaksana R.АмирхановаРаксана Руслановна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0002-1355-227XApryatkinaTatyana A.АпряткинаТатьяна Андреевна
Russian Federation

Resident

ординатор

krios.gip.14@mail.ruBashkir State Medical UniversityФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииDagestan State Medical UniversityФГБОУ ВО «Дагестанский государственный медицинский университет» Минздрава РоссииBurdenko Voronezh State Medical UniversityФГБОУ ВО «Воронежский государственный медицинский университет им. Н.Н. Бурденко» Минздрава России09062026285GastroenterologyГастроэнтерология3743802108202517092025Copyright ©; 2026, Consilium MedicumCopyright ©; 2026, ООО "Консилиум Медикум"2026Consilium MedicumООО "Консилиум Медикум"https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0https://consilium.orscience.ru/2075-1753/article/view/689713

This literature review systematically synthesizes current data on the regulatory role of non-coding RNAs (ncRNAs) and exosomes in the pathogenesis of inflammatory bowel disease (IBD). The review was prepared by searching PubMed, OVID MEDLINE, Google Scholar, and ScienceDirect databases for the period 2018–2025 using relevant keywords. Inclusion criteria were original studies investigating the molecular mechanisms of IBD, focusing on the role of ncRNAs and exosomes in IBD diagnosis and therapy. Various classes of ncRNAs were found to be key regulators of immune response, inflammation, and intestinal barrier integrity. Pro-inflammatory miRNAs (e.g., miR-21, miR-155) promote chronic inflammation by activating the NF-κB pathway, while reduced anti-inflammatory mirnas (e.g., miR-146a) can lead to immune system component dysfunction. Exosomes, in turn, mediate intercellular communication with ambivalent effects: they can exacerbate inflammation by transferring pro-inflammatory factors or exert significant therapeutic effects by delivering anti-inflammatory agents. Exosomes from mesenchymal stem cells showed the highest efficacy due to their ability to polarize macrophages towards an anti-inflammatory M2 phenotype, restore barrier function, and modulate cytokines. The findings open new perspectives for developing non-invasive diagnostic biomarkers based on ncRNAs and innovative therapeutic strategies, such as inhibiting pathogenic ncRNAs with antisense oligonucleotides and using anti-inflammatory exosomes for targeted therapy. However, standardization of isolation methods, biomarker validation, and addressing safety concerns for their application and production are necessary for clinical implementation.

Обзор литературы посвящен систематизации современных данных о регуляторной роли некодирующих РНК (нкРНК) и экзосом в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК). Для подготовки обзора проведен поиск в базах данных PubMed, OVID MEDLINE, Google Scholar и ScienceDirect за период с 2018 по 2025 г. с использованием ключевых слов, соответствующих тематике. Критериями включения стали оригинальные исследования, изучающие молекулярные механизмы ВЗК, с акцентом на роль нкРНК и экзосом в диагностике и терапии ВЗК. Установлено, что различные классы нкРНК являются ключевыми регуляторами иммунного ответа, воспаления и целостности кишечного барьера. Провоспалительные miRNA (такие как miR-21, miR-155) способствуют хронизации воспалительного процесса путем активации пути транскрипционного фактора, в то время как снижение противовоспалительных miRNA (miR-146a) может привести к дисфункции компонентов иммунной системы. Экзосомы, в свою очередь, выступают медиаторами межклеточной коммуникации, обладая амбивалентными эффектами: они могут как усугублять воспаление, перенося провоспалительные факторы, так и оказывать выраженный терапевтический эффект, доставляя противовоспалительные агенты. Экзосомы из мезенхимальных стволовых клеток показали наиболее высокую эффективность благодаря своей способности к поляризации макрофагов в противовоспалительный фенотип М2, восстановлению барьерной функции и модуляции цитокинов. Полученные данные открывают новые перспективы для разработки неинвазивных диагностических биомаркеров на основе нкРНК и инновационных терапевтических стратегий, таких как ингибирование патогенных нкРНК антисмысловыми олигонуклеотидами и применение противовоспалительных экзосом для таргетной терапии. Однако для внедрения в клиническую практику необходимы стандартизация методов выделения, валидация биомаркеров и решение вопросов безопасности их применения и производства.

inflammatory bowel diseasenon-coding RNAsCrohn’s diseaseulcerative colitisepigenetic regulationimmune regulationinflammationintestinal barrierexosomal vesiclesautoimmune processesвоспалительные заболевания кишечниканекодирующие РНКболезнь Кронаязвенный колитэпигенетическая регуляцияиммунная регуляциявоспалениекишечный барьерэкзосомальные везикулыаутоиммунные процессыОсипенко М.Ф., Валуйских Е.Ю., Светлова И.О., и др. Значение регистра воспалительных заболеваний кишечника для оценки качества лечебно-диагностических мероприятий. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2016;9(133):42-7 [Osipenko MF, Valuyskikh EYu, Svetlova IO, et al. The value of the register of inflammatory bowel diseases for assessing the quality of diagnostic and treatment measures. Eksperimentalnaia i klinicheskaia gastroenterologia. 2016;9(133):42-7 (in Russian)].Князев О.В., Шкурко Т.В., Фадеева Н.А., и др. Эпидемиология хронических воспалительных заболеваний кишечника. Вчера, сегодня, завтра. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2017;3(139):4-12 [Knyazev OV, Shkurko TV, Fadeeva NA, et al. Epidemiology of chronic inflammatory bowel diseases. Yesterday, today, tomorrow. Eksperimentalnaia i klinicheskaia gastroenterologia. 2017;3(139):4-12 (in Russian)].Kaplan GG, Bernstein CN, Coward S, et al. The impact of inflammatory bowel disease in Canada 2018: epidemiology. J Canadian Assoc Gastroenterol. 2019;2(Suppl. 1):S6-16. DOI:10.1093/jcag/gwy054Белоусова Е.А., Абдулганиева Д.И., Алексеева О.П., и др. Социально-демографическая характеристика, особенности течения и варианты лечения воспалительных заболеваний кишечника в России. Результаты двух многоцентровых исследований. Альманах клинической медицины. 2018;46(5):445-63 [Belousova EA, Abdulganieva DI, Alexeeva OP, et al. Socio-demographic characteristics, disease course features and treatment options for inflammatory bowel disease in Russia: Results of two multicenter studies. Almanakh klinicheskoi meditsiny. 2018;46(5):445-63 (in Russian)]. DOI:10.18786/2072-0505-2018-46-5-445-463Щиголева А.Е., Шумилов П.В., Шумилов А.П. Воспалительные заболевания кишечника с очень ранним началом. Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. 2018;97(6):141-6 [Shchigoleva AE, Shumilov PV, Shumilov AP. Inflammatory bowel disease with a very early onset. Pediatria. Zhurnal im. G.N. Speranskogo. 2018;97(6):141-6 (in Russian)]. DOI:10.24110/0031-403X-2018-97-6-141-146Katsanos KH, Papadakis KA. Inflammatory bowel disease: updates on molecular targets for biologics. Gut Liver. 2017;11(4):455-63. DOI:10.5009/gnl16308Хлынова О.В., Косарева П.В., Фадеев Д.С., и др. Роль В-лимфоцитов и плазматических клеток в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2023;6(214):39-46 [Khlynovа OV, Kosareva PV, Fadeev DS, et al. The role of B-lymphocytes and plasma cells in the pathogenesis of inflammatory bowel diseases. Eksperimentalnaia i klinicheskaia gastroenterologia. 2023;6(214):39-46 (in Russian)]. DOI:10.31146/1682-8658-ecg-214-6-39-46Saadh MJ, Allela OQB, Al-Hussainy AF, et al. Exosomal non-coding RNAs: gatekeepers of inflammation in autoimmune disease. J Inflammation. 2025;22(1):18. DOI:10.1186/s12950-025-00443-zFeng F, Jiao P, Wang J, et al. Role of long noncoding RNAs in the regulation of cellular immune response and inflammatory diseases. Cells. 2022;11(22):3642. DOI:10.3390/cells11223642Андреев В.П., Цыркунов В.М. Микро-РНК как потенциальные неинвазивные маркеры патологических состояний печени. Гепатология и гастроэнтерология. 2023;7(2):105-11 [Andreev VP, Tsyrkunov VM. Micro-RNA as potential non-invasive markers of pathological conditions of the liver. Gepatologia i gastroenterologia. 2023;7(2):105-11 (in Russian)]. DOI:10.25298/2616-5546-2023-7-2-105-111Roulé T, Christ A, Hussain N, et al. The lncRNA MARS modulates the epigenetic reprogramming of the marneral cluster in response to ABA. Molecular Plant. 2022;15(5):840-56. DOI:10.1016/j.molp.2022.02.007Santos AS, Santos-Bezerra DP, Ferreira LRP, et al. Relevance of Circulating microRNA, and their Association with Islet Cell Autoantibodies in Type 1 Diabetes Pathogenesis. Arch Med Res. 2025;56(2):103114. DOI:10.1016/j.arcmed.2024.103114Мудров В.П. РНК как биомаркер в клинической лабораторной диагностике. Лабораторная медицина. 2024;15(1-2):13-23 [Mudrov VP. RNA as a biomarker in clinical laboratory diagnostics. Laboratornaia meditsina. 2024;15(1-2):13-23 (in Russian)]. DOI:10.58953/15621790_2024_15_1-2_13Корнилов Д.О., Тряпицын М.А., Симарзина В.М., и др. Перспективы использования микроРНК в современных методах диагностики и терапии. Вестник уральской медицинской академической науки. 2022;19(2):109-31 [Kornilov DO, Tryapitsyn MA, Simarzina VM, et al. Prospects for the use of microRNA in modern methods of diagnosis and therapy. Vestnik uralskoi meditsinskoi akademicheskoi nauki. 2022;19(2):109-31 (in Russian)]. DOI:10.22138/2500-0918-2022-19-2-109-131Pan Y, Tang X, Xie Y, et al. Long non-coding RNA BCAR4 regulates osteosarcoma progression by targeting microRNA-1260a. Bulletin du Cancer. 2025;112(4):375-86. DOI:10.1016/j.bulcan.2024.09.003Lopez-Noriega L, Callingham R, Martinez-Sánchez A, et al. Roles for the long non-coding RNA Pax6os1/PAX6-AS1 in pancreatic beta cell function. iScience. 2025;28(1). DOI:10.1016/j.isci.2024.111518Dunn-Davies H, Dudnakova T, Nogara A, et al. Control of endothelial cell function and arteriogenesis by MEG3: EZH2 epigenetic regulation of integrin expression. Mol Ther Nucleic Acids. 2024;35(2). DOI:10.1016/j.omtn.2024.102173Avci CB, Edgunlu TG, Suzek T, et al. Propofol orchestrates long non-coding RNAs in MCF7 cells, unraveling new avenues for breast cancer intervention. Eur J Med Chem Rep. 2024;12:100186. DOI:10.1016/j.ejmcr.2024.100186Ma J, Zhang Y, Sun Z, et al. LncRNA PVT1 promotes cuproptosis through transcriptional activation of FDX1 in colorectal cancer. Redox Biol. 2025:103722. DOI:10.1016/j.redox.2025.103722Clua-Ferré L, Suau R, Vañó-Segarra I, et al. Therapeutic potential of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles: A focus on inflammatory bowel disease. Clin Transl Med. 2024;14(11):e70075. DOI:10.1002/ctm2.70075Коноплянников М.А., Князев О.В., Баклаушев В.П. Применение МСК для терапии воспалительных заболеваний кишечника. Клиническая практика. 2021;12(1):53-65 [Konopliannikov MA, Knyazev OV, Baklaushev VP. Primenenie MSK dlia terapii vospalitelnykh zabolevanii kishechnika. Klinicheskaia praktika. 2021;12(1):53-65 (in Russian)]. DOI:10.17816/clinpract64530Dong B, Wang C, Zhang J, et al. Exosomes from human umbilical cord mesenchymal stem cells attenuate the inflammation of severe steroid-resistant asthma by reshaping macrophage polarization. Stem Cell Res Ther. 2021;12(1):204. DOI:10.1186/s13287-021-02244-6Ning H, Chen H, Deng J, et al. Exosomes secreted by FNDC5-BMMSCs protect myocardial infarction by anti-inflammation and macrophage polarization via NF-κB signaling pathway and Nrf2/HO-1 axis. Stem Cell Res Ther. 2021;12(1):519. DOI:10.1186/s13287-021-02591-4Díez-Sainz E, Lorente-Cebrián S, Aranaz P, et al. Potential mechanisms linking food-derived microRNAs, gut microbiota and intestinal barrier functions in the context of nutrition and human health. Front Nutr. 2021;8:586564. DOI:10.3389/fnut.2021.586564Visnovitz T. Extracellular vesicles: biology and therapeutic applications. Int J Mol Sci. 2024;25(23):13034. DOI:10.3390/ijms252313034Xu Z, Zeng S, Gong Z, et al. Exosome-based immunotherapy: a promising approach for cancer treatment. Mol Cancer. 2020;19(1):160. DOI:10.1186/s12943-020-01278-3Cao L, Xu H, Wang G, et al. Extracellular vesicles derived from bone marrow mesenchymal stem cells attenuate dextran sodium sulfate-induced ulcerative colitis by promoting M2 macrophage polarization. Int Immunopharmacol. 2019;72:264-74. DOI:10.1016/j.intimp.2019.04.020Pessolano E, Belvedere R, Bizzarro V, et al. Annexin A1 contained in extracellular vesicles promotes the activation of keratinocytes by mesoglycan effects: an autocrine loop through FPRs. Cells. 2019;8(7):753. DOI:10.3390/cells8070753Li X, Corbett AL, Taatizadeh E, et al. Challenges and opportunities in exosome research – Perspectives from biology, engineering, and cancer therapy. APL Bioeng. 2019;3(1). DOI:10.1063/1.5087122Wang X, Zhou G, Zhou W, et al. Exosomes as a new delivery vehicle in inflammatory bowel disease. Pharmaceutics. 2021;13(10):1644. DOI:10.3390/pharmaceutics13101644Xie X, Liu P, Wu H, et al. miR-21 antagonist alleviates colitis and angiogenesis via the PTEN/PI3K/AKT pathway in colitis mice induced by TNBS. Ann Transl Med. 2022;10(7):413. DOI:10.21037/atm-22-944Park EJ, Shimaoka M, Kiyono H. Functional flexibility of exosomes and microRNAs of intestinal epithelial cells in affecting inflammation. Front Mol Biosci. 2022;9:854487. DOI:10.3389/fmolb.2022.854487Oliveira ECSD, Quaglio AEV, Magro DO, et al. Intestinal microbiota and miRNA in IBD: a narrative review about discoveries and perspectives for the future. Int J Mol Sci. 2023;24(8):7176. DOI:10.3390/ijms24087176Biswas S. Implications of Long Non-Coding RNAs in the Pathogenesis of Diabetic Retinopathy: A Novel Epigenetic Paradigm [Doctoral dissertation]. The University of Western Ontario (Canada); 2020. Available at: https://ir.lib.uwo.ca/etd/7116. Accessed: 15.08.2025.Li M, Zhao J, Cao M, et al. Mast cells-derived MiR-223 destroys intestinal barrier function by inhibition of CLDN8 expression in intestinal epithelial cells. Biol Res. 2020;53(1):12. DOI:10.1186/s40659-020-00279-2Inciuraite R, Ramonaite R, Kupcinskas J, et al. The microRNA expression in crypt-top and crypt-bottom colonic epithelial cell populations demonstrates cell-type specificity and correlates with endoscopic activity in ulcerative colitis. J Crohn's Colitis. 2024;18(12):2033-44. DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae108Appiah MG, Park EJ, Darkwah S, et al. Intestinal Epithelium-Derived Luminally Released Extracellular Vesicles in Sepsis Exhibit the Ability to Suppress TNF-α and IL-17A Expression in Mucosal Inflammation. Int J Mol Sci. 2020;21(22):8445. DOI:10.3390/ijms21228445Guo Y, Xu C, Gong R, et al. Exosomal CagA from Helicobacter pylori aggravates intestinal epithelium barrier dysfunction in chronic colitis by facilitating Claudin-2 expression. Gut Pathogens. 2022;14(1):13. DOI:10.1186/s13099-022-00486-0Larabi A, Dalmasso G, Delmas J, et al. Exosomes transfer miRNAs from cell-to-cell to inhibit autophagy during infection with Crohn’s disease-associated adherent-invasive E. coli. Gut Microbes. 2020;11(6):1677-94. DOI:10.1080/19490976.2020.1771985Yang S, Liang X, Song J, et al. A novel therapeutic approach for inflammatory bowel disease by exosomes derived from human umbilical cord mesenchymal stem cells to repair intestinal barrier via TSG-6. Stem Cell Res Ther. 2021;12(1):315. DOI:10.1186/s13287-021-02404-8Wohnhaas CT, Schmid R, Rolser M, et al. Fecal MicroRNAs show promise as noninvasive Crohn’s disease biomarkers. Crohn's Colitis 360. 2020;2(1):otaa003. DOI:10.1093/crocol/otaa003Lima JF, Cerqueira L, Figueiredo C, et al. Anti-miRNA oligonucleotides: A comprehensive guide for design. RNA Biol. 2018;15(3):338-52. DOI:10.1080/15476286.2018.1445959Wang H, Ye X, Spanos M, et al. Exosomal non-coding RNA mediates macrophage polarization: roles in cardiovascular diseases. Biology. 2023;12(5):745. DOI:10.3390/biology12050745Liu R, Tang A, Wang X, et al. Inhibition of lncRNA NEAT1 suppresses the inflammatory response in IBD by modulating the intestinal epithelial barrier and by exosome-mediated polarization of macrophages. Int J Mol Med. 2018;42(5):2903-13. DOI:10.3892/ijmm.2018.3829Ma F, Zhang S, Akanyibah FA, et al. Exosome-mediated macrophage regulation for inflammatory bowel disease repair: a potential target of gut inflammation. Am J Transl Res. 2023;15(12):6970.Awwad DA. Beyond classic editing: innovative CRISPR approaches for functional studies of long non-coding RNA. Biol Methods Protocols. 2019;4(1):bpz017. DOI:10.1093/biomethods/bpz017Yan B, Liang Y. New therapeutics for extracellular vesicles: delivering CRISPR for cancer treatment. Int J Mol Sci. 2022;23(24):15758. DOI:10.3390/ijms232415758